تنها چیزی که می تواند نانو حباب را برای آبزیان خطرناک کند، حجم یا مقدار زیادتر از استاندارد آنهاست. مثلاً اگر دی اکسید کربن هم بیش از حد استاندارد در آب باشد، برای آبزی خطرناک است، اکسیژن و نیتروژن هم به همین صورت، فشار بیش از حد گاز در داخل آب به هر حال می تواند آبزی را با مخاطرات مواجه کند. این خطر ربطی به نانو حباب یا میکرو حباب بودن ندارد و ماهیت کلی همه ی گازهای موجود در آب است. اما اگر قرار است نانو حباب اکسیژن در آب استفاده شود، تنها چیزی که باید مراقب بود، جلوگیری از افزایش بیش از حد استاندارد اکسیژن در آب است. در تحقیقات مختلفی که در سطح دنیا انجام شده ، تا به حال هیچ گزارشی از مضر بودن نانو حباب اکسیژن در آبزیان گزارش نشده است.
البته کنترل سایر پارامترهای آب نظیر آمونیاک ( آمونیوم) نیتریت و دی اکسید کربن، PH و دما نیز بسیار مهم است. مخصوصاً آمونیاک که با افرایش تراکم بیشتر و بیشتر شده و نیازمند طراحی سیستم های حذف آمونیاک می باشد.
